一、采購(gòu)項(xiàng)目名稱及內(nèi)容 采購(gòu)人：廣西壯族自治區(qū)疾病預(yù)防控制中心； 采購(gòu)項(xiàng)目名稱：免疫規(guī)劃?rùn)z測(cè)項(xiàng)目測(cè)序服務(wù)； 項(xiàng)目編號(hào)：--（重）； 資金來(lái)源：財(cái)政資金。 二、項(xiàng)目?jī)?nèi)容 （一）菌株全基因組測(cè)序：次。 ．樣本類型：純化后的滅活細(xì)菌。 ．提取：采用或的方法對(duì)樣本的基因組 進(jìn)行提取，之后利用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè) 的純度和完整性，利用進(jìn)行定量。 ．文庫(kù)構(gòu)建： 經(jīng)電泳檢測(cè)合格的 樣品用 超聲波破碎儀隨機(jī)打斷成長(zhǎng)度約為的片段。處理完成后的片段，使用 ?? (, )試劑盒，經(jīng)末端修復(fù)、加尾、加測(cè)序接頭、純化、擴(kuò)增等步驟完成整個(gè)文庫(kù)制備。 ．文庫(kù)檢測(cè)：文庫(kù)構(gòu)建完成后，先使用 . 進(jìn)行初步定量，稀釋文庫(kù)至 /，使用 對(duì)文庫(kù)的插入片段進(jìn)行檢測(cè)， 符合預(yù)期后，使用 - 方法對(duì)文庫(kù)的有效濃度進(jìn)行準(zhǔn)確定量，以保證文庫(kù)質(zhì)量。 ．測(cè)序和交付平臺(tái)：使用 上機(jī)測(cè)序，運(yùn)行智能化交付系統(tǒng)和自動(dòng)化樣本庫(kù)系統(tǒng)； ．?dāng)?shù)據(jù)質(zhì)量：原始下機(jī)數(shù)據(jù)測(cè)序質(zhì)量要求: ≥%，≥%； ．?dāng)?shù)據(jù)量： ≥/樣本； ．?dāng)?shù)據(jù)交付：需要交付 ； ．周期要求：需要保證項(xiàng)目可加急得到響應(yīng)，二代測(cè)序儀充足≥臺(tái)； ．生物信息學(xué)分析內(nèi)容： ①　原始下機(jī)數(shù)據(jù)處理:過(guò)濾測(cè)序質(zhì)量值低的，保留高質(zhì)量，得到 ； ②　樣品組裝: 進(jìn)行基因組組裝，得到能反映樣品基因組基本情況的序列文件，并對(duì)組裝結(jié)果進(jìn)行評(píng)價(jià)； ③　基因組組分分析 組裝完成后，分析樣品基因組的成分，包括編碼基因、非編碼、重復(fù)序列、前噬菌體、基因島、等基因組成分的預(yù)測(cè)； ④　功能注釋 針對(duì)編碼基因序列進(jìn)行不同數(shù)據(jù)庫(kù)的功能注釋，包括常用的、數(shù)據(jù)庫(kù)、針對(duì)病原微生物的數(shù)據(jù)庫(kù)； ⑤　基因組比較分析 此步驟從基因組、基因兩層面分別比較樣品與參考基因組的差異，包括共線性分析、基因家族構(gòu)建、共有/特有基因分析、物種進(jìn)化樹構(gòu)建。 （二）一代測(cè)定服務(wù)：....